レコード詳細
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OGRO: Overview of functionally characterized Genes in Rice Online database
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01235 |
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| 名称データベースの名称 | OGRO |
| 別称データベースの別称 | Overview of functionally characterized Genes in Rice Online database |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://qtaro.abr.affrc.go.jp/ogro/table |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 国立研究開発法人 農業・食品産業技術総合研究機構 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 |
| 説明データベースの説明 | 文献データベースWeb of Scienceに対して、遺伝子機能解析に用いられる用語をキーワードとして検索し抽出された文献のうち、遺伝子機能が表現型と関連づけられている文献から702の遺伝子座をイネにおける機能既知遺伝子としました(2012年3月31日現在)。最終的には、それらの情報を表現型、機能解析の方法およびゲノム位置の情報とともに、QTLデータベースであるQ-TARO (http://integbio.jp/dbcatalog/record/nbdc01234) と同一のプラットホーム（表とゲノムブラウザ）で表示可能なシステムを構築し、機能既知遺伝子のゲノム上の分布とQ-TAROに登録されているQTL領域などと比較できるようにしています。2012年現在、機能遺伝子情報は更新しています。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Oryza sativa (4530) |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 休止 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先 | ― |
| API / SPARQL endpoint | ― |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2012-12-10 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2015-04-02 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |