レコード詳細

MEO: Metagenome/Microbes Environmental Ontology
IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC01182 |
---|---|
名称データベースの名称 | MEO |
別称データベースの別称 | Metagenome/Microbes Environmental Ontology |
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | https://bioportal.bioontology.org/ontologies/MEO |
運用機関名現在データベースを運用している機関名 | Stanford Center for Biomedical Informatics Research |
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | アメリカ合衆国 |
説明データベースの説明 | 本DBは,微生物の生息環境に関するメタデータを記述し整理するためのオントロジーであるMEO (Metagenome/Microbes Environmental Ontology)のOWLファイルと,公共のメタゲノムデータのメタデータをMEO相手にマッピングしてサンプルごとに整理した結果のRDFファイルの2つから構成されたDBです。東京工業大学で作成・運用されていたMEO(http: //mdb.bio.titech.ac.jp/meo)のデータはBioportalに移されました。 |
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Bacteria (2) |
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 |
稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 |
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://bioportal.bioontology.org/ontologies/MEO |
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― |
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― |
データベースの使い方 | ― |
データベースの連絡先 | hmori@nig.ac.jp |
API / SPARQL endpoint | ― |
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― |
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
レコードの由来レコードの由来 |
![]() |
レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2012-07-10 |
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-05-22 |
本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |