レコード詳細
運用終了
Open TG-GATEs
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00954 |
|---|---|
| 名称データベースの名称 | Open TG-GATEs |
| 別称データベースの別称 | ― |
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://toxico.nibiohn.go.jp |
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 (J-Globalへのリンク) |
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 |
| 説明データベースの説明 | 131化合物（医薬品等）のin vivo（ラットの肝臓と腎臓）およびin vitro（ヒトとラットの肝細胞） 暴露データ（遺伝子発現データ、毒性学データ）を集積したデータベースです。遺伝子発現データと毒性学データを関連づけして閲覧することができるとともに、絞り込んだ遺伝子発現データをファイルとしてダウンロードすることも可能です。 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所によるOpen TG-GATEs のオリジナルサイト (https ://toxico.nibiohn.go.jp)の運用は終了しました。格納されていたデータはNBDCのデータベースアーカイブ ( https://dbarchive.biosciencedbc.jp/index.html ) より閲覧およびダウンロードが可能です。 |
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Homo sapiens (9606), Rattus norvegicus (10116) |
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
|
| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
|
| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI | ― |
| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 日本語, 英語 |
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 運用終了 |
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/open-tggates/download.html |
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/open-tggates/LATEST/README.html |
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/open-tggates/lic.html |
| データベースの使い方 | ― |
| データベースの連絡先 | ― |
| API / SPARQL endpoint | ― |
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | https://dbarchive.biosciencedbc.jp/?dblist_search=open%20tg-gates |
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― |
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | ― |
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― |
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog |
| レコードの由来レコードの由来 |
|
| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 |
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2025-02-28 |
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |