レコード詳細

Thumbnail

PGE (アーカイブ): Gene Expression Pattern Database of Mouse Embryos

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00777
名称データベースの名称 PGE (アーカイブ)
別称データベースの別称 Gene Expression Pattern Database of Mouse Embryos
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pge/desc.html
運用機関名現在データベースを運用している機関名 国立研究開発法人科学技術振興機構 NBDC事業推進部 (J-Globalへのリンク)
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 日本
説明データベースの説明 哺乳類の初期発生における非対称性の出現を遺伝子レベルから探るために、マウス初期胚で発現している約25000個のcDNAの部分塩基配列を決定し、胚の体軸形成に関連する遺伝子や約4000の新規遺伝子を見い出しました。受精卵、2細胞期、4細胞期、8細胞期、16細胞期、胞胚期のEST解析による発現量をデータベース化したものです。現在は提供を終了し、過去のデータセットは生命科学系データベースアーカイブから取得可能です。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID Mus musculus (10090)
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:10725249
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 日本語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pge/download.html
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/pge/LATEST/README.html
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pge/lic.html
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク https://dbarchive.biosciencedbc.jp/jp/pge/desc.html
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク
類似データベースこのデータベースに類似したデータベース
レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2022-05-29
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license