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GOA: Gene Ontology Annotation Database

IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 NBDC00468
名称データベースの名称 GOA
別称データベースの別称 Gene Ontology Annotation Database
URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL https://www.ebi.ac.uk/GOA
運用機関名現在データベースを運用している機関名 European Bioinformatics Institute
運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 イギリス
説明データベースの説明 UniProtKBのタンパク質、RNAcentralのRNA分子、Complex Portalの複合タンパク質に高精度のGOアノテーションを付加するためのデータベースです。遺伝子産物とGOタームの関連付けには電子アノテーション手法が用いられ、公開された文献から手動で抽出したGOタームにより補強されています。Uniprotやプロテオーム、もしくは生物種別のGOAがダウンロードできます。
生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID
タグ (対象)データベースに収録された主要データの対象を表すタグ
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI
PubMed ID:18957448
DOI:-
PubMed ID:22123736
DOI:-
PubMed ID:19744993
DOI:-
言語データベースの内容の記載に使用されている言語 英語
稼動状況データベースの稼動状況 稼動中
一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク https://www.ebi.ac.uk/GOA/downloads
一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa/UNIPROT/README
データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/GO/goa/UNIPROT/README
データベースの使い方
データベースの連絡先
API / SPARQL endpoint
LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク
MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク
統合TVへのリンク統合TVへのリンク
FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク https://fairsharing.org/biodbcore-000313
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レコード管理者レコード管理者 Integbio Database Catalog
レコードの由来レコードの由来
レコード公開日日本語レコードの公開日 2011-12-08
レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 2018-11-11
本レコードの利用条件 Creative Commons CC0 license