レコード詳細
CyanoBase: Genome database for Cyanobacteria
| IDNBDC共通のデータベースID。日本語と英語など、タイトルが複数存在する場合は括弧を使用して併記する。 | NBDC00034 | ||||||||||||||||||||||||
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| 名称データベースの名称 | CyanoBase | ||||||||||||||||||||||||
| 別称データベースの別称 | Genome database for Cyanobacteria | ||||||||||||||||||||||||
| URLデータベースをWebで公開している場合、そのURL | http://genome.microbedb.jp/cyanobase | ||||||||||||||||||||||||
| 運用機関名現在データベースを運用している機関名 | 公益財団法人 かずさDNA研究所 (J-Globalへのリンク) | ||||||||||||||||||||||||
| 運用機関所在国・地域運用機関が所在する国及び地域名 | 日本 | ||||||||||||||||||||||||
| 説明データベースの説明 | 財団法人かずさDNA研究所で全ゲノム配列決定したシアノバクテリアを含む、シアノバクテリア、緑色硫黄細菌、紅色非硫黄細菌の全ゲノム配列解析結果を収録しています。2017年にリリースされた新バージョンでは370を超える種が収録されています。ゲノム配列、染色体マップ、遺伝子アノテーション、遺伝子機能カテゴリ、文献、公共データベースのリンク等が閲覧できます。各エントリのAPIの項目からは、その生物の様々なデータがダウンロードできます。 | ||||||||||||||||||||||||
| 生物種データベースが扱う生物のTaxonomy NameとNCBI TaxonomyのID | Cyanobacteria (1117) | ||||||||||||||||||||||||
| タグ （対象）データベースに収録された主要データの対象を表すタグ |
ゲノム/遺伝子
cDNA/EST
遺伝的多様性
エピジェネティクス
DNA
RNA
タンパク質
糖質
脂質
代謝物
化学物質
薬
細胞/オルガネラ
個体/種
健康/疾患
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| タグ (データの種類)データベースに収録された主要データの種類を表すタグ |
表現型
バイオリソース
手法
オントロジー/用語/命名法
環境
配列
3D構造
化学構造
発現
局在
地理的分布
相互作用/パスウェイ
生物分類
分類
画像/動画
書誌/ドキュメント
ポータル
リポジトリ
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| 論文等 (PubMed ID/DOI)当該データベースに関連した論文のPubMed ID/DOI |
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| 言語データベースの内容の記載に使用されている言語 | 英語 | ||||||||||||||||||||||||
| 稼動状況データベースの稼動状況 | 稼動中 | ||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータへのリンク一括ダウンロードデータへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||
| 一括ダウンロードデータのデータ説明一括ダウンロードデータのデータ説明 | ― | ||||||||||||||||||||||||
| データベースの利用許諾へのリンク一括ダウンロードデータの利用条件 | ― | ||||||||||||||||||||||||
| データベースの使い方 | ― | ||||||||||||||||||||||||
| データベースの連絡先 | ― | ||||||||||||||||||||||||
| API / SPARQL endpoint | ― | ||||||||||||||||||||||||
| LSDBアーカイブへのリンクLSDBアーカイブへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||
| MEDALSデータベース便覧へのリンクMEDALSデータベース便覧へのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||
| 統合TVへのリンク統合TVへのリンク | http://togotv.dbcls.jp/result.html?type=manual&page=1&query=CyanoBase | ||||||||||||||||||||||||
| FAIRsharingへのリンクFAIRsharingへのリンク | ― | ||||||||||||||||||||||||
| 類似データベースこのデータベースに類似したデータベース | |||||||||||||||||||||||||
| レコード管理者レコード管理者 | Integbio Database Catalog | ||||||||||||||||||||||||
| レコードの由来レコードの由来 |
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| レコード公開日日本語レコードの公開日 | 2011-12-08 | ||||||||||||||||||||||||
| レコード最終更新日日本語レコードの最終更新日 | 2022-09-15 | ||||||||||||||||||||||||
| 本レコードの利用条件 | Creative Commons CC0 license |